Algoritmo consegue diferenciar células cancerosas das saudáveis pelo RNA

Ferramenta permite a análise rápida de grandes conjuntos de dados de sequenciamento de RNA retirados de uma única célula cancerosa
Por Renato Mota, editado por Flávio Pinto 21/01/2021 15h17, atualizada em 21/01/2021 16h25
1610735753791
University of Texas/MD Anderson Cancer Center
Compartilhe esta matéria
Ícone Whatsapp Ícone Whatsapp Ícone X (Tweeter) Ícone Facebook Ícone Linkedin Ícone Telegram Ícone Email

Siga o Olhar Digital no Google Discover

Cientistas da Universidade do Texas desenvolveram uma nova técnica computacional que consegue para diferenciar, com precisão quase absoluta, células cancerosas das saudáveis por meio da análise de sequenciamento de RNA. O trabalho foi publicado na Nature Biotechnology e a ferramenta está disponível gratuitamente.

Ofertas

Tilibra - Estojo Minibox Happy Lilás
Vendido por Amazon
Tilibra - Estojo Minibox Happy Lilás
De: R$ 38,12
Por: R$ 36,21
Caneta Gel – CiS Gelyx – Estojo com 6 unidades – Glitter
Vendido por Amazon
Caneta Gel – CiS Gelyx – Estojo com 6 unidades – Glitter
De: R$ 30,90
Por: R$ 24,96
Pentel Caneta Izee 4 Cores 1.0 Corpo Branco Tinta Azul Vermelho Verde e Preto SM/BXC470W
Vendido por Amazon
Pentel Caneta Izee 4 Cores 1.0 Corpo Branco Tinta Azul Vermelho Verde e Preto SM/BXC470W
De: R$ 15,32
Por: R$ 9,90
Tilibra - Caderno Brochura Capa Dura 1/4 D+ Rosa 48 Folhas, 317403
Vendido por Amazon
Tilibra - Caderno Brochura Capa Dura 1/4 D+ Rosa 48 Folhas, 317403
De: R$ 11,85
Por: R$ 5,86
Celular Positivo P26 4G Tela 1,8", Câmera traseira, 48MB RAM 128MB, Bluetooth, Modem Tethering - Preto
Vendido por Amazon
Celular Positivo P26 4G Tela 1,8", Câmera traseira, 48MB RAM 128MB, Bluetooth, Modem Tethering - Preto
Por R$ 139,90
Mochila Grande E Reforçada Impermeável Para Notebook Antifurto Bolsa Executiva Masculina Feminina Trabalho Viagem Escolar Faculdade Cabo De Aço Saída Usb Saída Fone De Ouvido
Vendido por Amazon
Mochila Grande E Reforçada Impermeável Para Notebook Antifurto Bolsa Executiva Masculina Feminina Trabalho Viagem Escolar Faculdade Cabo De Aço Saída Usb Saída Fone De Ouvido
De: R$ 149,79
Por: R$ 113,70
Tilibra D+ - Caderno Brochura Capa Dura, 1/4 Pequeno, 14x20cm, 48 Folhas, Vermelho
Vendido por Amazon
Tilibra D+ - Caderno Brochura Capa Dura, 1/4 Pequeno, 14x20cm, 48 Folhas, Vermelho
De: R$ 11,81
Por: R$ 6,90
Agenda 2026 Coleção Happy Com Capa Dura Círculos Colors
Vendido por Amazon
Agenda 2026 Coleção Happy Com Capa Dura Círculos Colors
Por R$ 45,90
Suporte para 2 Controles de PlayStation 5 PS5, Apoio de Mesa Gamer, Modelo VN
Vendido por Amazon
Suporte para 2 Controles de PlayStation 5 PS5, Apoio de Mesa Gamer, Modelo VN
De: R$ 39,92
Por: R$ 37,92
Pasta Sanfonada DAC A4 Com 12 Divisões All Black Preto
Vendido por Amazon
Pasta Sanfonada DAC A4 Com 12 Divisões All Black Preto
De: R$ 27,90
Por: R$ 22,59
Carregador Fonte para Notebook Asus 19V 2.37A 45W com Pino Fino 4.0x1.35mm, compatível com VivoBook X543ua X543ma X515 X512 X510U ZenBook 14 UX433FA UX431FA X512F, referência Ad2108020 bivolt
Vendido por Amazon
Carregador Fonte para Notebook Asus 19V 2.37A 45W com Pino Fino 4.0x1.35mm, compatível com VivoBook X543ua X543ma X515 X512 X510U ZenBook 14 UX433FA UX431FA X512F, referência Ad2108020 bivolt
De: R$ 67,44
Por: R$ 59,95
Garmin Relógio Venu 3 Branco 45mm com Monitor Cardíaco de Pulso e GPS
Vendido por Amazon
Garmin Relógio Venu 3 Branco 45mm com Monitor Cardíaco de Pulso e GPS
De: R$ 4.699,00
Por: R$ 3.099,00
eufy Câmera S3 Pro Kit 2+1 por anker, Câmera De Segurança Wi-Fi Externa Sem Fio, 4K, Energia Solar, Visão Noturna MaxColor, Reconhecimento Facial por IA, Compatível com Alexa, Sem taxas mensais
Vendido por Amazon
eufy Câmera S3 Pro Kit 2+1 por anker, Câmera De Segurança Wi-Fi Externa Sem Fio, 4K, Energia Solar, Visão Noturna MaxColor, Reconhecimento Facial por IA, Compatível com Alexa, Sem taxas mensais
De: R$ 3.499,00
Por: R$ 3.324,00
eufy HomeBase3, Câmera de segurança, Reconhecimento Facial por IA, Armazenamento Local Expansível até 16TB, Criptografia Avançada, Ecossistema de Segurança eufy, Sem taxas mensais
Vendido por Amazon
eufy HomeBase3, Câmera de segurança, Reconhecimento Facial por IA, Armazenamento Local Expansível até 16TB, Criptografia Avançada, Ecossistema de Segurança eufy, Sem taxas mensais
De: R$ 1.049,00
Por: R$ 799,00
Bettdow SmartWatch, Relogio Smartwatch Feminino, 1.27" Ecrã tátil, à prova d'água IP68, 100+ Modos Esportivos, chamada Bluetooth, Compatível com Android iOS, voz por IA (Azul)
Vendido por Amazon
Bettdow SmartWatch, Relogio Smartwatch Feminino, 1.27" Ecrã tátil, à prova d'água IP68, 100+ Modos Esportivos, chamada Bluetooth, Compatível com Android iOS, voz por IA (Azul)
De: R$ 299,00
Por: R$ 241,44
Combo Teclado e Mouse sem fio Logitech POP Icon com Teclas e Botões Personalizáveis, Clique Silencioso, Easy-Switch para até 3 dispositivos e Conexão Bluetooth - Grafite
Vendido por Amazon
Combo Teclado e Mouse sem fio Logitech POP Icon com Teclas e Botões Personalizáveis, Clique Silencioso, Easy-Switch para até 3 dispositivos e Conexão Bluetooth - Grafite
De: R$ 499,90
Por: R$ 388,78
eufy Câmera S330 (eufyCam 3) 2-Cam Kit por anker, Câmera De Segurança Wi-Fi Externa Sem Fio, 4K, Painel Solar, Forever Power, Reconhecimento Facial IA, Armazenamento Local Até 16TB, Sem Taxa Mensal
Vendido por Amazon
eufy Câmera S330 (eufyCam 3) 2-Cam Kit por anker, Câmera De Segurança Wi-Fi Externa Sem Fio, 4K, Painel Solar, Forever Power, Reconhecimento Facial IA, Armazenamento Local Até 16TB, Sem Taxa Mensal
De: R$ 2.399,00
Por: R$ 2.159,00
soundcore Select 4 Go da Anker, Alto-Falante Bluetooth Portátil, 20H de Bateria, IP67 à Prova d'Água e Poeira, Flutuante, Som Potente, Ideal para Ambientes Internos, Externos e Passeios
Vendido por Amazon
soundcore Select 4 Go da Anker, Alto-Falante Bluetooth Portátil, 20H de Bateria, IP67 à Prova d'Água e Poeira, Flutuante, Som Potente, Ideal para Ambientes Internos, Externos e Passeios
De: R$ 339,00
Por: R$ 188,99
WB Smart Tag Localizador Bluetooth, Rastreador Compatível com o Apple Find My, bateria substituível, Localizador de itens para bolsas
Vendido por Amazon
WB Smart Tag Localizador Bluetooth, Rastreador Compatível com o Apple Find My, bateria substituível, Localizador de itens para bolsas
De: R$ 88,00
Por: R$ 45,00
Anker Nano Carregador Portátil, Power Bank Compacto 10000mAh 45W Máx., Bateria Portátil Essencial para Viagens com Cabo Retrátil InstaCord de 70 cm para iPhone 17/16 Series, iPad, Galaxy, Pixel e Mais
Vendido por Amazon
Anker Nano Carregador Portátil, Power Bank Compacto 10000mAh 45W Máx., Bateria Portátil Essencial para Viagens com Cabo Retrátil InstaCord de 70 cm para iPhone 17/16 Series, iPad, Galaxy, Pixel e Mais
De: R$ 399,00
Por: R$ 379,00
Capa com Teclado Combo Touch para iPad (10ª geração e A16) Com Teclado Retroiluminado Destacável com Suporte, Trackpad Preciso e Tecnologia Smart Connector - Cinza
Vendido por Amazon
Capa com Teclado Combo Touch para iPad (10ª geração e A16) Com Teclado Retroiluminado Destacável com Suporte, Trackpad Preciso e Tecnologia Smart Connector - Cinza
De: R$ 1.629,90
Por: R$ 1.239,90
ULANZI VL-200Bi 200W luz de estúdio bicolor, luz de preenchimento COB, iluminação de saída contínua com controle de APP, 2700K-6500K, 6 cenas, montagem Bowens
Vendido por Amazon
ULANZI VL-200Bi 200W luz de estúdio bicolor, luz de preenchimento COB, iluminação de saída contínua com controle de APP, 2700K-6500K, 6 cenas, montagem Bowens
De: R$ 1.179,00
Por: R$ 943,20
eufy Câmera S350, Camera de Segurança Wi-Fi, 4K Inteligente com Câmera Dupla, Visão 360°, Zoom 8×, Visão Noturna, Babá Eletrônica, Rastreamento por IA, Compatível com Alexa e HomeBase 3
Vendido por Amazon
eufy Câmera S350, Camera de Segurança Wi-Fi, 4K Inteligente com Câmera Dupla, Visão 360°, Zoom 8×, Visão Noturna, Babá Eletrônica, Rastreamento por IA, Compatível com Alexa e HomeBase 3
De: R$ 999,00
Por: R$ 798,99
WAAW By ALOK Fone de Ouvido Bluetooth SENSE 310 Com Cancelamento de Ruído e Assistente de Voz, 30h de Bateria
Vendido por Amazon
WAAW By ALOK Fone de Ouvido Bluetooth SENSE 310 Com Cancelamento de Ruído e Assistente de Voz, 30h de Bateria
De: R$ 329,90
Por: R$ 199,00
WAAW by ALOK Caixa de Som US 200SB DUO Bluetooth 2 em 1, Resistente à Água, Acabamento Metálico, TWS, 20W RMS
Vendido por Amazon
WAAW by ALOK Caixa de Som US 200SB DUO Bluetooth 2 em 1, Resistente à Água, Acabamento Metálico, TWS, 20W RMS
De: R$ 599,90
Por: R$ 476,10
Eufy Cam E340 Câmera De Segurança Wi-Fi Dual Band (2.4/5GHz) Exterior, 360° PTZ, Gravação 24/7, 2000 Lúmens, Detecção de Movimento + Sirene Integrada, Câmera Dupla, Sem Taxa Mensal, Branco
Vendido por Amazon
Eufy Cam E340 Câmera De Segurança Wi-Fi Dual Band (2.4/5GHz) Exterior, 360° PTZ, Gravação 24/7, 2000 Lúmens, Detecção de Movimento + Sirene Integrada, Câmera Dupla, Sem Taxa Mensal, Branco
De: R$ 1.199,00
Por: R$ 1.139,05
Novo Kindle Paperwhite Signature Edition (32 GB) - O Kindle mais rápido já lançado, com luz frontal autoadaptável, carregamento sem fio e bateria que dura semanas - Cor Preta Metálica
Vendido por Amazon
Novo Kindle Paperwhite Signature Edition (32 GB) - O Kindle mais rápido já lançado, com luz frontal autoadaptável, carregamento sem fio e bateria que dura semanas - Cor Preta Metálica
De: R$ 1.199,00
Por: R$ 949,00
Combo Teclado e Mouse Sem Fio Logitech MK250 Bluetooth com Conectividade Rápida e Fácil, Design Compacto, Mouse Ambidestro, Layout ABNT2, Construção Durável, Compatível com PC e Mac - Rosa
Vendido por Amazon
Combo Teclado e Mouse Sem Fio Logitech MK250 Bluetooth com Conectividade Rápida e Fácil, Design Compacto, Mouse Ambidestro, Layout ABNT2, Construção Durável, Compatível com PC e Mac - Rosa
Por R$ 169,90
Combo Teclado e Mouse sem fio Logitech MK235 com Conexão USB, Pilhas Inclusas e Layout ABNT2
Vendido por Amazon
Combo Teclado e Mouse sem fio Logitech MK235 com Conexão USB, Pilhas Inclusas e Layout ABNT2
De: R$ 149,90
Por: R$ 119,90
Anker MagGo Power Bank, Carregador Portátil com Certificação Qi2 de 15W, Compatível com MagSafe, 10.000mAh, Tela Inteligente e Suporte Dobrável, para iPhone 17/15/14/13/12, Inclui Cabo USB-C, Branco
Vendido por Amazon
Anker MagGo Power Bank, Carregador Portátil com Certificação Qi2 de 15W, Compatível com MagSafe, 10.000mAh, Tela Inteligente e Suporte Dobrável, para iPhone 17/15/14/13/12, Inclui Cabo USB-C, Branco
De: R$ 699,00
Por: R$ 398,99
Mouse Sem Fio Logitech M330 SILENT com Clique Silencioso, Design Destro, Bateria de 18 Meses, Receptor USB, Compatível com Windows, macOS, ChromeOS e Pilha Inclusa - Preto
Vendido por Amazon
Mouse Sem Fio Logitech M330 SILENT com Clique Silencioso, Design Destro, Bateria de 18 Meses, Receptor USB, Compatível com Windows, macOS, ChromeOS e Pilha Inclusa - Preto
De: R$ 109,90
Por: R$ 79,90
Webcam Full HD Logitech Brio 100 com Microfone Integrado, Proteção de Privacidade, Correção Automática de Luz e Conexão USB-C - Grafite
Vendido por Amazon
Webcam Full HD Logitech Brio 100 com Microfone Integrado, Proteção de Privacidade, Correção Automática de Luz e Conexão USB-C - Grafite
De: R$ 299,90
Por: R$ 199,90

Chamado de CopyKAT, o sistema permite a análise rápida de grandes conjuntos de dados de sequenciamento de RNA retirados de uma única célula. Essas cadeias de proteínas fornecem dados de expressão gênica de muitos milhares de células individuais, nas quais os cientistas podem procurar por cromossomos anormais, comuns na maioria dos tumores.

“Desenvolvemos o CopyKAT como uma ferramenta para inferir informações genéticas a partir dos dados do transcriptoma”, explica Nicholas Navin, professor de Genética e Biologia Computacional da Universidade do Texas. Foram analisadas 46.501 células únicas de 21 tumores, incluindo câncer de mama triplo-negativo, adenocarcinoma ductal pancreático, câncer anaplásico de tireoide, carcinoma ductal invasivo e glioblastoma.

“Ao aplicar essa ferramenta a vários conjuntos de dados, mostramos que podíamos identificar, com cerca de 99% de precisão, células tumorais em meio a outras células imunológicas ou estromais presentes em uma amostra de tumor mista”, conta Navin.

Ao examinar a expressão do gene de cada célula individual, pesquisadores puderam desenvolver uma imagem da paisagem do tumor, incluindo o microambiente circundante. Imagem: CI Photos/Shutterstock

A ferramenta também ajuda a identificar subpopulações distintas, ou clones, dentro das células cancerosas. “Poderemos então dar um passo adiante, e entender as diferenças genéticas entre os subclones presentes”, completa o pesquisador.

Historicamente, os tumores têm sido estudados como uma mistura de todas as células presentes, muitas das quais não são cancerosas. Por meio do sequenciamento de RNA, cientistas puderam analisar tumores em uma resolução muito maior. Porém, ainda havia o desafio de distinguir entre células cancerosas e células normais.

Os algoritmos do CopyKAT aprimoram técnicas computacionais mais antigas, aumentando a precisão e ajustando a análise para a mais nova geração de dados de sequenciamento de RNA. “Fomos capazes de identificar subpopulações raras em cânceres de mama triplo-negativos que têm alterações genéticas únicas”, lembra a professora assistente de Ciências Cardiovasculares, Ruli Gao, que desenvolveu os algoritmos do sistema.

“Esperamos que esta ferramenta seja útil para a comunidade de pesquisa para aproveitar ao máximo seus dados de sequenciamento de RNA de uma única célula e para conduzir novas descobertas no câncer”, completa a pesquisadora.

Redator(a)

Renato Mota é redator(a) no Olhar Digital

Redator(a)

Flávio Pinto é redator(a) no Olhar Digital